Polska jesień charakteryzuje się dużymi dobowymi wahaniami temperatury i wilgotności.

Szczególnie jesienią należy dbać o higienę w pieczarkarni. Pamiętajmy, że sprawcami wielu problemów w tym okresie są muchówki i sucha zgnilizna. Dlatego dokładnie należy sprawdzać szczelność hal uprawowych, a zwłaszcza stan uszczelek w drzwiach. Należy regularnie kontrolować i wymieniać filtry. Trzeba zwrócić uwagę gdzie składowany jest kompost popieczarkowy i inne odpady produkcyjne (np. korzonki).